E-Layanan Sains BRIN | Badan Riset dan Inovasi Nasional

JASA SEKUENSING PLATFORM OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES - ONT

Layanan Kontraktual

DESKRIPSI LAYANAN | Jasa layanan sekuensing platform nanopore meliputi dua jenis tipe mesin: 1. Promethion 24 PromethION adalah perangkat sekuen high-throughput yang dikembangkan oleh Oxford Nanopore Technologies. Promethion di desain untuk menghasilkan data sekuen long…

Laboratorium Pusat Sekuensing
Direktorat Pengelolaan Laboratorium, Fasilitas Riset, dan Kawasan Sains dan Teknologi
Bogor - Cibinong
Gedung Genomik Lantai 4 Jl Raya Bogor Km 46 Cibinong - Bogor Jawa Barat
08119811574
pusatsekuensing@brin.go.id

Satuan Layanan: Per Kontrak
Waktu Pengerjaan Layanan: 28 Hari Kerja
Kuota Pelayanan Per Hari: 24
Kapasitas Layanan: 1 Per Kontrak
Jumlah Minimal Pengajuan: 1

Marketing Office

Deputi Bidang Infrastruktur Riset dan Inovasi BRIN

layanan_sains@brin.go.id

Jasa layanan sekuensing platform nanopore meliputi dua jenis tipe mesin:

1. Promethion 24

PromethION adalah perangkat sekuen high-throughput yang dikembangkan oleh Oxford Nanopore Technologies. Promethion di desain untuk menghasilkan data sekuen long reads yang besar secara real time. Promethion24 dapat run 1 hingga 24 flow cell sehingga dapat memproses sejumlah besar sampel secara bersamaan. Output data sekuen yang dihasilkan per flowcell maksimum 290Gb bervariasi tergantung kondisi tipe library, sampel dan lain-lain. Reagen sekuensing yang tersedia : ligation sequencing kit, ligation native barcoding kit, ligation rapid barcoding kit. Aplikasi Promethion meliputi penelitian larger genome (WGS, populasi genomik hewan dan tumbuhan); Studi lingkungan dan biodiversitas (analisa sampel linkungan untuk mempelajari komunitas mikroba, keanekaragaman hayati dan interaksi ekologi); multipleks genom kecil (mikroba) dan gen target (amplikon).

2. Minion Mk1C

MinION adalah perangkat sekuen portabel yang dikembangkan oleh Oxford Nanopore Technologies. instrumen yang ringkas dan serbaguna ini di desain untuk menghasilkan data sekuen long reads secara real time. Minion hanya dapat digunakan untuk 1 flowcell dalam sekali run. Output data sekuen yang dihasilkan per flowcell maksimum 50Gb bervariasi tergantung kondisi tipe library, sampel dan lain-lain. Reagen sekuensing yang tersedia yaitu ligation sequencing kit, ligation native barcoding kit, ligation rapid barcoding kit. Aplikasi Minion meliputi whole genome sequencing; metagenomik dan surveilans patogen.

Syarat Pengajuan: